1949年5月，人民解放军解放上海之际，中共上海地下党负责人叶正龙获悉，国民党特务组织企图炸毁我上海沪江发电厂，此企图被国民党特务组织命名为“萤火虫计划”。为了粉碎萤火虫计划，上海市公安局侦察科在科长叶正龙的带领下，和国民党特务组织斗智斗勇，展开了一系列的侦破工作，并积极设计，建设地下应急发电组。在工作过程中，出现了国民党特务组织蓄谋制造的破坏事件。经过一番努力，叶正龙不负众望，最终揪出了隐藏在我上海市公安局内部，代号为“老鹰”的国民党特务，并粉碎了国民党特务组织的“萤火虫计划”。

童年时代的悲惨遭遇让麦克和父亲查理之间有着深深的隔阂。如今已经成为知名小说家的麦克刚刚完成了一本名叫《花园里的萤火虫》的小说，这本小说记载了他童年的全部伤痛。母亲莉莎终于完成大学的喜讯让迈克尔回到了家乡，这里有他所熟悉的一切，亦有让他痛苦不已的往昔。不幸的是，当麦克踏进家门之时，等待着他的却是母亲在车祸中不幸丧生的噩耗，看着悲痛的父亲，麦克开始重新思考起亲情的意义。对于麦克的新书，父亲暴跳如雷，他将它看作是儿子对于自己的控诉，矛盾重新在父子两人之间爆发开来。

作品改编自川口雅幸老师创作的同名小说，故事讲述由于交通事故而失去了父亲的小学六年级学生裕太，在水库那里穿越时空回到已经被掩埋的30年前的乡村，描写了1970年代的日本乡村的自然景观以及裕太与孩子们的友情。

三轮元年幼时遇到过一个非常善良的老师，因此毕生的志愿就是成为一名和他一样的老师。师范毕业之后，三轮元被派往偏僻的乡村小学就职，那里的孩子们自幼出生在贫困的家庭之中，问题多多，难缠的家长和冥顽不灵的学校领导让三轮元四面楚歌，焦头烂额。尽管情势十分的不乐观，但三轮元仍旧没有放弃希望，他发起了“萤火虫饲养计划”，希望能够通过这一举动加深师生之间的羁绊。琪琪从小生活在破碎的家庭之中，性格十分的孤僻冷漠，但是她却相信，只要能够放飞萤火虫，就能够重新获得失去的母爱。

影片通过主人公的回忆，讲述了男孩10岁那年，在乡下的叔叔家度过的一个有趣夏天的故事。废弃的池塘，在孩子们的眼里，是一个令人难以置信的神奇王国。草丛、池塘、蜻蜓、仙女、龙、蝾螈、萤火虫灯......每一个场景都能勾起童年时的回忆。